Yayasan Pondok Pesantren Ath-Thoyyibah Sidoarjo adalah Yayasan Dakwah yang bergerak dalam bidang pendidikan. Sebagai lembaga pendidikan dasar menyelenggarakan kegiatan pendidikan yang mengedepankan nilai islam dalam pengajaran, bertujuan untuk melahirkan generasi masa depan bangsa yang tidak hanya cerdas secara kognitif tetapi berketerampilan dan berkakhlaq karimah.

Dalam melaksanakan fungsinya Yayasan Pondok Pesantren Ath-Thoyyibah Sidoarjo berasas Islam.